五岁的宗介与妈妈理莎，住在一个靠海小村庄的山崖上。身为船长的爸爸常年出海，留下宗介与妈妈相依为命。五岁的宗介从小就非常懂事，一天当他在山崖下岩石遍布的海滩上玩耍，他拾回了一只被困在玻璃瓶里的人鱼波妞，宗介救出波妞并且将她养在一个绿色的塑胶水桶里。
因此波妞和中介相互为对方着迷中介对波妞说“别担心，我会保护你，好好照顾你”
波妞想要变成人类和中介生活在一起这种强烈的欲望让波妞生出了手和脚。
波妞在被父亲抓回大海后，为了再次见到宗介，也为了吃到好吃的火腿，在妹妹们的帮助下逃离父亲的囚禁，从海里一路奔跑而来。她乘着风，踏着浪，张开双臂，那副天真的模样让人越看越喜欢。
踏着海，迎着风
是啊，因为喜欢宗介，所以乘风踏浪也要去见他。
波妞经历千辛万苦来到宗介的身边，迅速变成一个五岁人类女孩的模样。她飞快地扑到宗介怀里，宗介一下就认出了波妞。
是啊，因为宗介心里盛满了爱，所以他很快就能认出波妞。而宗介的母亲丽莎，也非常温柔的带着两个孩子回到家里。
一起吃饭
宗介和波妞一起吃泡面的时候，波妞吃着吃着就困了，迷迷糊糊地想要睡觉。
一起睡觉
宗介问妈妈丽莎： “波妞是从很远很远的地方来的吧？”是啊，波妞为了见你，从很远很远的地方跑了过来。
波妞和宗介一起坐着船去找丽莎。两个小孩子手拉着手，穿过漫水的小镇、穿过幽静的隧道。两个小孩子坐在一起的画面，被描绘得如此真实朴素，却感人至深。两个小孩因为相互喜欢，相互爱而走到了一起。
故事结局波妞被她妈妈取消了她的魔法能力，变成了一个真正的人类女孩，和宗介永远在一起。最终由波妞造成的大水也退去，人们可以继续过平静的幸福生活。
宫崎骏通过两个五岁的小孩子，诠释了什么是真正的爱情。
